Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGY8

Arfgef3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef3Q3UGY8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Arfgef3Q3UGY8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms