Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFT3

Garem1, GRB2-associated and regulator of MAPK protein, mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garem1Q3UFT3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Garem1Q3UFT3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Garem1Q3UFT3 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Garem1Q3UFT3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Garem1Q3UFT3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Garem1Q3UFT3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Garem1Q3UFT3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Garem1Q3UFT3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Garem1Q3UFT3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Garem1Q3UFT3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Garem1Q3UFT3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Garem1Q3UFT3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Garem1Q3UFT3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Garem1Q3UFT3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Garem1Q3UFT3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Garem1Q3UFT3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Garem1Q3UFT3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Garem1Q3UFT3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Garem1Q3UFT3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Garem1Q3UFT3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Garem1Q3UFT3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Garem1Q3UFT3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Garem1Q3UFT3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Garem1Q3UFT3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Garem1Q3UFT3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Garem1Q3UFT3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Garem1Q3UFT3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Garem1Q3UFT3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Garem1Q3UFT3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Garem1Q3UFT3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Garem1Q3UFT3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Garem1Q3UFT3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Garem1Q3UFT3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Garem1Q3UFT3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Garem1Q3UFT3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Garem1Q3UFT3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Garem1Q3UFT3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Garem1Q3UFT3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Garem1Q3UFT3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Garem1Q3UFT3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Garem1Q3UFT3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Garem1Q3UFT3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Garem1Q3UFT3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Garem1Q3UFT3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Garem1Q3UFT3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Garem1Q3UFT3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Garem1Q3UFT3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Garem1Q3UFT3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Garem1Q3UFT3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Garem1Q3UFT3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Garem1Q3UFT3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Garem1Q3UFT3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Garem1Q3UFT3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Garem1Q3UFT3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Garem1Q3UFT3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Garem1Q3UFT3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Garem1Q3UFT3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Garem1Q3UFT3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Garem1Q3UFT3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Garem1Q3UFT3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Garem1Q3UFT3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Garem1Q3UFT3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Garem1Q3UFT3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Garem1Q3UFT3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Garem1Q3UFT3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Garem1Q3UFT3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Garem1Q3UFT3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Garem1Q3UFT3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Garem1Q3UFT3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Garem1Q3UFT3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Garem1Q3UFT3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Garem1Q3UFT3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Garem1Q3UFT3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Garem1Q3UFT3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Garem1Q3UFT3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Garem1Q3UFT3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Garem1Q3UFT3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Garem1Q3UFT3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Garem1Q3UFT3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Garem1Q3UFT3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Garem1Q3UFT3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Garem1Q3UFT3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Garem1Q3UFT3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Garem1Q3UFT3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Garem1Q3UFT3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Garem1Q3UFT3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Garem1Q3UFT3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Garem1Q3UFT3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Garem1Q3UFT3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Garem1Q3UFT3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Garem1Q3UFT3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Garem1Q3UFT3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Garem1Q3UFT3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Garem1Q3UFT3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Garem1Q3UFT3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Garem1Q3UFT3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Garem1Q3UFT3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Garem1Q3UFT3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Garem1Q3UFT3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Garem1Q3UFT3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms