Protein–RNA interactions for Protein: Q3UF64

Rnft2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft2Q3UF64 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rnft2Q3UF64 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rnft2Q3UF64 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms