Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms