Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3U595 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3U595 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3U595 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3U595 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3U595 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3U595 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3U595 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3U595 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3U595 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3U595 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3U595 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3U595 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3U595 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3U595 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3U595 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3U595 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3U595 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3U595 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U595 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U595 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U595 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U595 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U595 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U595 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U595 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U595 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U595 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U595 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U595 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U595 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U595 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U595 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U595 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U595 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U595 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U595 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U595 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U595 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U595 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U595 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U595 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U595 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U595 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Q3U595 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U595 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q3U595 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q3U595 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q3U595 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q3U595 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q3U595 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q3U595 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q3U595 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q3U595 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q3U595 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q3U595 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q3U595 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q3U595 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q3U595 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Q3U595 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q3U595 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q3U595 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q3U595 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q3U595 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q3U595 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q3U595 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q3U595 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Q3U595 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q3U595 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q3U595 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q3U595 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q3U595 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q3U595 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q3U595 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q3U595 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q3U595 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q3U595 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q3U595 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q3U595 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q3U595 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q3U595 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q3U595 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q3U595 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q3U595 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q3U595 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Q3U595 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q3U595 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q3U595 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q3U595 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q3U595 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Q3U595 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q3U595 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Q3U595 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q3U595 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q3U595 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q3U595 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q3U595 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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