Protein–RNA interactions for Protein: Q3U515

Vwce, von Willebrand factor C and EGF domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 929 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VwceQ3U515 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
VwceQ3U515 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VwceQ3U515 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VwceQ3U515 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
VwceQ3U515 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VwceQ3U515 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VwceQ3U515 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VwceQ3U515 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VwceQ3U515 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VwceQ3U515 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VwceQ3U515 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VwceQ3U515 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VwceQ3U515 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VwceQ3U515 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VwceQ3U515 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VwceQ3U515 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VwceQ3U515 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VwceQ3U515 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VwceQ3U515 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VwceQ3U515 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VwceQ3U515 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VwceQ3U515 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VwceQ3U515 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VwceQ3U515 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VwceQ3U515 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VwceQ3U515 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VwceQ3U515 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VwceQ3U515 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VwceQ3U515 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VwceQ3U515 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
VwceQ3U515 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VwceQ3U515 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
VwceQ3U515 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VwceQ3U515 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VwceQ3U515 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VwceQ3U515 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VwceQ3U515 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VwceQ3U515 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VwceQ3U515 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VwceQ3U515 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VwceQ3U515 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VwceQ3U515 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VwceQ3U515 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VwceQ3U515 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VwceQ3U515 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VwceQ3U515 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VwceQ3U515 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VwceQ3U515 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VwceQ3U515 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
VwceQ3U515 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VwceQ3U515 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VwceQ3U515 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VwceQ3U515 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VwceQ3U515 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VwceQ3U515 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VwceQ3U515 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VwceQ3U515 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VwceQ3U515 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VwceQ3U515 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VwceQ3U515 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VwceQ3U515 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VwceQ3U515 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VwceQ3U515 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VwceQ3U515 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VwceQ3U515 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VwceQ3U515 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VwceQ3U515 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VwceQ3U515 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VwceQ3U515 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VwceQ3U515 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VwceQ3U515 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VwceQ3U515 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VwceQ3U515 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VwceQ3U515 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VwceQ3U515 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VwceQ3U515 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VwceQ3U515 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VwceQ3U515 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VwceQ3U515 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
VwceQ3U515 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VwceQ3U515 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VwceQ3U515 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VwceQ3U515 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
VwceQ3U515 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VwceQ3U515 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VwceQ3U515 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VwceQ3U515 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VwceQ3U515 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VwceQ3U515 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VwceQ3U515 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VwceQ3U515 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VwceQ3U515 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VwceQ3U515 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VwceQ3U515 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VwceQ3U515 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VwceQ3U515 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VwceQ3U515 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VwceQ3U515 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VwceQ3U515 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VwceQ3U515 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms