Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4N7

Igflr1, IGF-like family receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igflr1Q3U4N7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Igflr1Q3U4N7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Igflr1Q3U4N7 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Igflr1Q3U4N7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Igflr1Q3U4N7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Igflr1Q3U4N7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Igflr1Q3U4N7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Igflr1Q3U4N7 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Igflr1Q3U4N7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Igflr1Q3U4N7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Igflr1Q3U4N7 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Igflr1Q3U4N7 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Igflr1Q3U4N7 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Igflr1Q3U4N7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Igflr1Q3U4N7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Igflr1Q3U4N7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Igflr1Q3U4N7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Igflr1Q3U4N7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Igflr1Q3U4N7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Igflr1Q3U4N7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Igflr1Q3U4N7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Igflr1Q3U4N7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Igflr1Q3U4N7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Igflr1Q3U4N7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Igflr1Q3U4N7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Igflr1Q3U4N7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Igflr1Q3U4N7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Igflr1Q3U4N7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Igflr1Q3U4N7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Igflr1Q3U4N7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Igflr1Q3U4N7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Igflr1Q3U4N7 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Igflr1Q3U4N7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Igflr1Q3U4N7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Igflr1Q3U4N7 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Igflr1Q3U4N7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Igflr1Q3U4N7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Igflr1Q3U4N7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Igflr1Q3U4N7 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Igflr1Q3U4N7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Igflr1Q3U4N7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Igflr1Q3U4N7 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Igflr1Q3U4N7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Igflr1Q3U4N7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Igflr1Q3U4N7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Igflr1Q3U4N7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Igflr1Q3U4N7 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Igflr1Q3U4N7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Igflr1Q3U4N7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Igflr1Q3U4N7 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Igflr1Q3U4N7 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Igflr1Q3U4N7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Igflr1Q3U4N7 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Igflr1Q3U4N7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Igflr1Q3U4N7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Igflr1Q3U4N7 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Igflr1Q3U4N7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Igflr1Q3U4N7 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Igflr1Q3U4N7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Igflr1Q3U4N7 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Igflr1Q3U4N7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Igflr1Q3U4N7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Igflr1Q3U4N7 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Igflr1Q3U4N7 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Igflr1Q3U4N7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Igflr1Q3U4N7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Igflr1Q3U4N7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Igflr1Q3U4N7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Igflr1Q3U4N7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Igflr1Q3U4N7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Igflr1Q3U4N7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Igflr1Q3U4N7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Igflr1Q3U4N7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Igflr1Q3U4N7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Igflr1Q3U4N7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Igflr1Q3U4N7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Igflr1Q3U4N7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Igflr1Q3U4N7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Igflr1Q3U4N7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Igflr1Q3U4N7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Igflr1Q3U4N7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Igflr1Q3U4N7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Igflr1Q3U4N7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Igflr1Q3U4N7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Igflr1Q3U4N7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Igflr1Q3U4N7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Igflr1Q3U4N7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Igflr1Q3U4N7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Igflr1Q3U4N7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Igflr1Q3U4N7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Igflr1Q3U4N7 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Igflr1Q3U4N7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Igflr1Q3U4N7 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Igflr1Q3U4N7 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Igflr1Q3U4N7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Igflr1Q3U4N7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Igflr1Q3U4N7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Igflr1Q3U4N7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Igflr1Q3U4N7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Igflr1Q3U4N7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms