Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Ssbp4Q3U4B1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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