Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms