Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K0

Fam193b, Protein FAM193B, mousemouse

Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam193bQ3U2K0 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms