Protein–RNA interactions for Protein: Q3U213

Serac1, Protein SERAC1, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serac1Q3U213 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Serac1Q3U213 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Serac1Q3U213 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Serac1Q3U213 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Serac1Q3U213 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Serac1Q3U213 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Serac1Q3U213 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Serac1Q3U213 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Serac1Q3U213 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Serac1Q3U213 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Serac1Q3U213 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Serac1Q3U213 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Serac1Q3U213 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Serac1Q3U213 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Serac1Q3U213 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Serac1Q3U213 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Serac1Q3U213 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Serac1Q3U213 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Serac1Q3U213 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Serac1Q3U213 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Serac1Q3U213 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Serac1Q3U213 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Serac1Q3U213 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Serac1Q3U213 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Serac1Q3U213 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Serac1Q3U213 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Serac1Q3U213 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Serac1Q3U213 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Serac1Q3U213 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Serac1Q3U213 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Serac1Q3U213 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Serac1Q3U213 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Serac1Q3U213 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Serac1Q3U213 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Serac1Q3U213 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Serac1Q3U213 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Serac1Q3U213 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Serac1Q3U213 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Serac1Q3U213 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Serac1Q3U213 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Serac1Q3U213 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Serac1Q3U213 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Serac1Q3U213 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Serac1Q3U213 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Serac1Q3U213 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Serac1Q3U213 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Serac1Q3U213 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Serac1Q3U213 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms