Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D9

UPF0602 protein C4orf47 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U1D9 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q3U1D9 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q3U1D9 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Q3U1D9 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Q3U1D9 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Q3U1D9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q3U1D9 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q3U1D9 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q3U1D9 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q3U1D9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q3U1D9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q3U1D9 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3U1D9 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3U1D9 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3U1D9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q3U1D9 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3U1D9 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3U1D9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3U1D9 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q3U1D9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3U1D9 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q3U1D9 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Q3U1D9 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q3U1D9 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3U1D9 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Q3U1D9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q3U1D9 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3U1D9 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3U1D9 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q3U1D9 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3U1D9 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3U1D9 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3U1D9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q3U1D9 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3U1D9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Q3U1D9 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3U1D9 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3U1D9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3U1D9 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3U1D9 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Q3U1D9 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3U1D9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Q3U1D9 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Q3U1D9 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3U1D9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3U1D9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3U1D9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3U1D9 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Q3U1D9 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Q3U1D9 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Q3U1D9 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q3U1D9 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3U1D9 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3U1D9 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3U1D9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q3U1D9 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q3U1D9 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3U1D9 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Q3U1D9 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Q3U1D9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Q3U1D9 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q3U1D9 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q3U1D9 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q3U1D9 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q3U1D9 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Q3U1D9 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q3U1D9 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q3U1D9 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q3U1D9 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Q3U1D9 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q3U1D9 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q3U1D9 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q3U1D9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q3U1D9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q3U1D9 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Q3U1D9 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Q3U1D9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q3U1D9 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Q3U1D9 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q3U1D9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q3U1D9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q3U1D9 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q3U1D9 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q3U1D9 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q3U1D9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3U1D9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3U1D9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3U1D9 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3U1D9 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q3U1D9 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3U1D9 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3U1D9 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Q3U1D9 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Q3U1D9 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q3U1D9 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Q3U1D9 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3U1D9 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3U1D9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3U1D9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3U1D9 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms