Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc174Q3U155 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc174Q3U155 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc174Q3U155 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc174Q3U155 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc174Q3U155 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc174Q3U155 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc174Q3U155 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc174Q3U155 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc174Q3U155 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc174Q3U155 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc174Q3U155 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc174Q3U155 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc174Q3U155 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc174Q3U155 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc174Q3U155 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc174Q3U155 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc174Q3U155 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc174Q3U155 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc174Q3U155 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc174Q3U155 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc174Q3U155 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc174Q3U155 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc174Q3U155 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc174Q3U155 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc174Q3U155 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc174Q3U155 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc174Q3U155 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc174Q3U155 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc174Q3U155 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc174Q3U155 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc174Q3U155 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc174Q3U155 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc174Q3U155 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc174Q3U155 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc174Q3U155 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc174Q3U155 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc174Q3U155 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc174Q3U155 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc174Q3U155 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc174Q3U155 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc174Q3U155 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc174Q3U155 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc174Q3U155 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc174Q3U155 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc174Q3U155 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc174Q3U155 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc174Q3U155 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc174Q3U155 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc174Q3U155 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc174Q3U155 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc174Q3U155 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc174Q3U155 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc174Q3U155 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc174Q3U155 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc174Q3U155 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc174Q3U155 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc174Q3U155 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc174Q3U155 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc174Q3U155 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc174Q3U155 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms