Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXT3

Inip, SOSS complex subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InipQ3TXT3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms