Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ccdc136Q3TVA9 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ccdc136Q3TVA9 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Ccdc136Q3TVA9 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Ccdc136Q3TVA9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Ccdc136Q3TVA9 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Ccdc136Q3TVA9 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Ccdc136Q3TVA9 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
Ccdc136Q3TVA9 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Ccdc136Q3TVA9 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Ccdc136Q3TVA9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Ccdc136Q3TVA9 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Ccdc136Q3TVA9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Ccdc136Q3TVA9 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Ccdc136Q3TVA9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Ccdc136Q3TVA9 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Ccdc136Q3TVA9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Ccdc136Q3TVA9 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
Ccdc136Q3TVA9 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Ccdc136Q3TVA9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Ccdc136Q3TVA9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Ccdc136Q3TVA9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Ccdc136Q3TVA9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Ccdc136Q3TVA9 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ccdc136Q3TVA9 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ccdc136Q3TVA9 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ccdc136Q3TVA9 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ccdc136Q3TVA9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ccdc136Q3TVA9 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ccdc136Q3TVA9 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ccdc136Q3TVA9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Ccdc136Q3TVA9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Ccdc136Q3TVA9 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Ccdc136Q3TVA9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Ccdc136Q3TVA9 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Ccdc136Q3TVA9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Ccdc136Q3TVA9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Ccdc136Q3TVA9 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Ccdc136Q3TVA9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Ccdc136Q3TVA9 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Ccdc136Q3TVA9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ccdc136Q3TVA9 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ccdc136Q3TVA9 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ccdc136Q3TVA9 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ccdc136Q3TVA9 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Ccdc136Q3TVA9 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ccdc136Q3TVA9 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ccdc136Q3TVA9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ccdc136Q3TVA9 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ccdc136Q3TVA9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ccdc136Q3TVA9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ccdc136Q3TVA9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ccdc136Q3TVA9 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ccdc136Q3TVA9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ccdc136Q3TVA9 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ccdc136Q3TVA9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ccdc136Q3TVA9 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ccdc136Q3TVA9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ccdc136Q3TVA9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ccdc136Q3TVA9 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ccdc136Q3TVA9 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ccdc136Q3TVA9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ccdc136Q3TVA9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ccdc136Q3TVA9 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ccdc136Q3TVA9 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
Ccdc136Q3TVA9 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ccdc136Q3TVA9 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ccdc136Q3TVA9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ccdc136Q3TVA9 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ccdc136Q3TVA9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ccdc136Q3TVA9 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ccdc136Q3TVA9 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ccdc136Q3TVA9 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ccdc136Q3TVA9 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ccdc136Q3TVA9 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ccdc136Q3TVA9 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Ccdc136Q3TVA9 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Ccdc136Q3TVA9 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ccdc136Q3TVA9 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ccdc136Q3TVA9 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ccdc136Q3TVA9 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ccdc136Q3TVA9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ccdc136Q3TVA9 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ccdc136Q3TVA9 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
Ccdc136Q3TVA9 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
Ccdc136Q3TVA9 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
Ccdc136Q3TVA9 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ccdc136Q3TVA9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ccdc136Q3TVA9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Ccdc136Q3TVA9 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Ccdc136Q3TVA9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Ccdc136Q3TVA9 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Ccdc136Q3TVA9 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Ccdc136Q3TVA9 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Ccdc136Q3TVA9 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Ccdc136Q3TVA9 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Ccdc136Q3TVA9 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Ccdc136Q3TVA9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Ccdc136Q3TVA9 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Ccdc136Q3TVA9 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms