Protein–RNA interactions for Protein: Q3TT99

Gdpd4, Glycerophosphodiester phosphodiesterase domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd4Q3TT99 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gdpd4Q3TT99 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gdpd4Q3TT99 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Gdpd4Q3TT99 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gdpd4Q3TT99 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gdpd4Q3TT99 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gdpd4Q3TT99 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gdpd4Q3TT99 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gdpd4Q3TT99 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gdpd4Q3TT99 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gdpd4Q3TT99 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gdpd4Q3TT99 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gdpd4Q3TT99 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gdpd4Q3TT99 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gdpd4Q3TT99 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gdpd4Q3TT99 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gdpd4Q3TT99 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gdpd4Q3TT99 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gdpd4Q3TT99 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gdpd4Q3TT99 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gdpd4Q3TT99 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gdpd4Q3TT99 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gdpd4Q3TT99 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gdpd4Q3TT99 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gdpd4Q3TT99 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gdpd4Q3TT99 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gdpd4Q3TT99 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gdpd4Q3TT99 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gdpd4Q3TT99 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gdpd4Q3TT99 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gdpd4Q3TT99 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gdpd4Q3TT99 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gdpd4Q3TT99 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gdpd4Q3TT99 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gdpd4Q3TT99 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gdpd4Q3TT99 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gdpd4Q3TT99 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gdpd4Q3TT99 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gdpd4Q3TT99 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gdpd4Q3TT99 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gdpd4Q3TT99 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gdpd4Q3TT99 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gdpd4Q3TT99 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gdpd4Q3TT99 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gdpd4Q3TT99 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gdpd4Q3TT99 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gdpd4Q3TT99 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gdpd4Q3TT99 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gdpd4Q3TT99 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gdpd4Q3TT99 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gdpd4Q3TT99 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gdpd4Q3TT99 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gdpd4Q3TT99 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gdpd4Q3TT99 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gdpd4Q3TT99 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gdpd4Q3TT99 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gdpd4Q3TT99 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gdpd4Q3TT99 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gdpd4Q3TT99 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gdpd4Q3TT99 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gdpd4Q3TT99 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gdpd4Q3TT99 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gdpd4Q3TT99 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gdpd4Q3TT99 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gdpd4Q3TT99 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gdpd4Q3TT99 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gdpd4Q3TT99 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gdpd4Q3TT99 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gdpd4Q3TT99 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gdpd4Q3TT99 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gdpd4Q3TT99 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gdpd4Q3TT99 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gdpd4Q3TT99 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gdpd4Q3TT99 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gdpd4Q3TT99 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gdpd4Q3TT99 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gdpd4Q3TT99 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gdpd4Q3TT99 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gdpd4Q3TT99 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gdpd4Q3TT99 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gdpd4Q3TT99 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gdpd4Q3TT99 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gdpd4Q3TT99 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gdpd4Q3TT99 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gdpd4Q3TT99 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gdpd4Q3TT99 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gdpd4Q3TT99 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gdpd4Q3TT99 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gdpd4Q3TT99 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gdpd4Q3TT99 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gdpd4Q3TT99 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gdpd4Q3TT99 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gdpd4Q3TT99 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gdpd4Q3TT99 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gdpd4Q3TT99 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gdpd4Q3TT99 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gdpd4Q3TT99 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gdpd4Q3TT99 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gdpd4Q3TT99 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gdpd4Q3TT99 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms