Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQS0

Calr4, Calreticulin 4, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr4Q3TQS0 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Calr4Q3TQS0 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Calr4Q3TQS0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Calr4Q3TQS0 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Calr4Q3TQS0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Calr4Q3TQS0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Calr4Q3TQS0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Calr4Q3TQS0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Calr4Q3TQS0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Calr4Q3TQS0 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Calr4Q3TQS0 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Calr4Q3TQS0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Calr4Q3TQS0 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Calr4Q3TQS0 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Calr4Q3TQS0 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Calr4Q3TQS0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Calr4Q3TQS0 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Calr4Q3TQS0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Calr4Q3TQS0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Calr4Q3TQS0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Calr4Q3TQS0 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Calr4Q3TQS0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Calr4Q3TQS0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Calr4Q3TQS0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Calr4Q3TQS0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Calr4Q3TQS0 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Calr4Q3TQS0 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Calr4Q3TQS0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Calr4Q3TQS0 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Calr4Q3TQS0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Calr4Q3TQS0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Calr4Q3TQS0 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Calr4Q3TQS0 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Calr4Q3TQS0 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Calr4Q3TQS0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Calr4Q3TQS0 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Calr4Q3TQS0 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Calr4Q3TQS0 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Calr4Q3TQS0 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Calr4Q3TQS0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Calr4Q3TQS0 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Calr4Q3TQS0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Calr4Q3TQS0 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Calr4Q3TQS0 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Calr4Q3TQS0 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Calr4Q3TQS0 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Calr4Q3TQS0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Calr4Q3TQS0 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Calr4Q3TQS0 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Calr4Q3TQS0 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Calr4Q3TQS0 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Calr4Q3TQS0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Calr4Q3TQS0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Calr4Q3TQS0 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Calr4Q3TQS0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Calr4Q3TQS0 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Calr4Q3TQS0 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Calr4Q3TQS0 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Calr4Q3TQS0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Calr4Q3TQS0 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Calr4Q3TQS0 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Calr4Q3TQS0 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Calr4Q3TQS0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Calr4Q3TQS0 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Calr4Q3TQS0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Calr4Q3TQS0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Calr4Q3TQS0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Calr4Q3TQS0 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Calr4Q3TQS0 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Calr4Q3TQS0 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Calr4Q3TQS0 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Calr4Q3TQS0 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Calr4Q3TQS0 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Calr4Q3TQS0 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Calr4Q3TQS0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Calr4Q3TQS0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Calr4Q3TQS0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Calr4Q3TQS0 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Calr4Q3TQS0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Calr4Q3TQS0 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Calr4Q3TQS0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Calr4Q3TQS0 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Calr4Q3TQS0 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Calr4Q3TQS0 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Calr4Q3TQS0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Calr4Q3TQS0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Calr4Q3TQS0 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Calr4Q3TQS0 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Calr4Q3TQS0 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Calr4Q3TQS0 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Calr4Q3TQS0 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Calr4Q3TQS0 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Calr4Q3TQS0 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Calr4Q3TQS0 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Calr4Q3TQS0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Calr4Q3TQS0 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Calr4Q3TQS0 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Calr4Q3TQS0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Calr4Q3TQS0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Calr4Q3TQS0 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms