Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQ03

Ciart, Circadian-associated transcriptional repressor, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiartQ3TQ03 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms