Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc10Q3TLI0 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc10Q3TLI0 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc10Q3TLI0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc10Q3TLI0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc10Q3TLI0 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc10Q3TLI0 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc10Q3TLI0 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc10Q3TLI0 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc10Q3TLI0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc10Q3TLI0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc10Q3TLI0 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc10Q3TLI0 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc10Q3TLI0 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc10Q3TLI0 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc10Q3TLI0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc10Q3TLI0 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc10Q3TLI0 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc10Q3TLI0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc10Q3TLI0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc10Q3TLI0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc10Q3TLI0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc10Q3TLI0 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc10Q3TLI0 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc10Q3TLI0 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc10Q3TLI0 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc10Q3TLI0 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc10Q3TLI0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc10Q3TLI0 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc10Q3TLI0 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc10Q3TLI0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc10Q3TLI0 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc10Q3TLI0 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc10Q3TLI0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc10Q3TLI0 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc10Q3TLI0 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc10Q3TLI0 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc10Q3TLI0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc10Q3TLI0 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc10Q3TLI0 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc10Q3TLI0 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc10Q3TLI0 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc10Q3TLI0 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc10Q3TLI0 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc10Q3TLI0 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc10Q3TLI0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc10Q3TLI0 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc10Q3TLI0 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc10Q3TLI0 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc10Q3TLI0 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc10Q3TLI0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc10Q3TLI0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc10Q3TLI0 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc10Q3TLI0 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc10Q3TLI0 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc10Q3TLI0 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc10Q3TLI0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc10Q3TLI0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc10Q3TLI0 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc10Q3TLI0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc10Q3TLI0 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc10Q3TLI0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc10Q3TLI0 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc10Q3TLI0 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc10Q3TLI0 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc10Q3TLI0 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc10Q3TLI0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc10Q3TLI0 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc10Q3TLI0 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc10Q3TLI0 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc10Q3TLI0 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc10Q3TLI0 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc10Q3TLI0 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc10Q3TLI0 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc10Q3TLI0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc10Q3TLI0 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc10Q3TLI0 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc10Q3TLI0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc10Q3TLI0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc10Q3TLI0 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc10Q3TLI0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc10Q3TLI0 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc10Q3TLI0 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc10Q3TLI0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc10Q3TLI0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc10Q3TLI0 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc10Q3TLI0 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc10Q3TLI0 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc10Q3TLI0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc10Q3TLI0 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms