Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms