Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBN1

Tmem248, Transmembrane protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem248Q3TBN1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms