Protein–RNA interactions for Protein: Q3TB48

Tmem104, Transmembrane protein 104, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem104Q3TB48 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem104Q3TB48 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem104Q3TB48 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem104Q3TB48 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem104Q3TB48 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem104Q3TB48 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem104Q3TB48 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem104Q3TB48 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem104Q3TB48 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem104Q3TB48 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem104Q3TB48 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem104Q3TB48 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Tmem104Q3TB48 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms