Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms