Protein–RNA interactions for Protein: Q2TV84

Trpm1, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm1Q2TV84 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Trpm1Q2TV84 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trpm1Q2TV84 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trpm1Q2TV84 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trpm1Q2TV84 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trpm1Q2TV84 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trpm1Q2TV84 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trpm1Q2TV84 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trpm1Q2TV84 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trpm1Q2TV84 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trpm1Q2TV84 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trpm1Q2TV84 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trpm1Q2TV84 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trpm1Q2TV84 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trpm1Q2TV84 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trpm1Q2TV84 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trpm1Q2TV84 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trpm1Q2TV84 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Trpm1Q2TV84 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trpm1Q2TV84 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trpm1Q2TV84 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Trpm1Q2TV84 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trpm1Q2TV84 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trpm1Q2TV84 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trpm1Q2TV84 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trpm1Q2TV84 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Trpm1Q2TV84 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Trpm1Q2TV84 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Trpm1Q2TV84 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trpm1Q2TV84 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trpm1Q2TV84 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trpm1Q2TV84 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trpm1Q2TV84 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trpm1Q2TV84 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trpm1Q2TV84 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trpm1Q2TV84 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trpm1Q2TV84 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trpm1Q2TV84 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trpm1Q2TV84 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trpm1Q2TV84 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trpm1Q2TV84 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Trpm1Q2TV84 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trpm1Q2TV84 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trpm1Q2TV84 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trpm1Q2TV84 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trpm1Q2TV84 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trpm1Q2TV84 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trpm1Q2TV84 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Trpm1Q2TV84 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trpm1Q2TV84 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trpm1Q2TV84 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trpm1Q2TV84 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trpm1Q2TV84 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trpm1Q2TV84 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trpm1Q2TV84 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trpm1Q2TV84 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trpm1Q2TV84 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trpm1Q2TV84 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trpm1Q2TV84 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trpm1Q2TV84 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Trpm1Q2TV84 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Trpm1Q2TV84 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trpm1Q2TV84 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trpm1Q2TV84 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trpm1Q2TV84 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trpm1Q2TV84 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trpm1Q2TV84 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trpm1Q2TV84 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trpm1Q2TV84 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trpm1Q2TV84 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trpm1Q2TV84 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trpm1Q2TV84 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trpm1Q2TV84 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trpm1Q2TV84 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Trpm1Q2TV84 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trpm1Q2TV84 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trpm1Q2TV84 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trpm1Q2TV84 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trpm1Q2TV84 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Trpm1Q2TV84 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trpm1Q2TV84 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trpm1Q2TV84 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trpm1Q2TV84 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trpm1Q2TV84 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trpm1Q2TV84 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trpm1Q2TV84 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Trpm1Q2TV84 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Trpm1Q2TV84 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Trpm1Q2TV84 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trpm1Q2TV84 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trpm1Q2TV84 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trpm1Q2TV84 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trpm1Q2TV84 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trpm1Q2TV84 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Trpm1Q2TV84 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trpm1Q2TV84 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trpm1Q2TV84 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trpm1Q2TV84 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trpm1Q2TV84 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trpm1Q2TV84 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms