Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
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Shroom4Q1W617 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Shroom4Q1W617 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
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Shroom4Q1W617 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Shroom4Q1W617 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
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Shroom4Q1W617 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Shroom4Q1W617 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Shroom4Q1W617 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
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Shroom4Q1W617 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
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Shroom4Q1W617 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
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Shroom4Q1W617 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
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Shroom4Q1W617 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Shroom4Q1W617 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
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Shroom4Q1W617 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Shroom4Q1W617 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Shroom4Q1W617 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
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Shroom4Q1W617 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Shroom4Q1W617 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Shroom4Q1W617 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Shroom4Q1W617 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
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Shroom4Q1W617 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
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Shroom4Q1W617 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Shroom4Q1W617 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Shroom4Q1W617 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
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Shroom4Q1W617 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
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Shroom4Q1W617 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
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Shroom4Q1W617 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
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Shroom4Q1W617 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Shroom4Q1W617 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Shroom4Q1W617 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
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Shroom4Q1W617 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Shroom4Q1W617 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Shroom4Q1W617 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Shroom4Q1W617 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Shroom4Q1W617 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Shroom4Q1W617 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Shroom4Q1W617 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Shroom4Q1W617 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Shroom4Q1W617 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Shroom4Q1W617 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Shroom4Q1W617 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Shroom4Q1W617 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Shroom4Q1W617 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Shroom4Q1W617 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Shroom4Q1W617 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Shroom4Q1W617 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Shroom4Q1W617 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Shroom4Q1W617 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Shroom4Q1W617 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
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