Protein–RNA interactions for Protein: Q1HDU4

Arhgap9, ArhGAP9, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap9Q1HDU4 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arhgap9Q1HDU4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arhgap9Q1HDU4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Arhgap9Q1HDU4 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Arhgap9Q1HDU4 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Arhgap9Q1HDU4 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Arhgap9Q1HDU4 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Arhgap9Q1HDU4 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Arhgap9Q1HDU4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Arhgap9Q1HDU4 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Arhgap9Q1HDU4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Arhgap9Q1HDU4 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arhgap9Q1HDU4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arhgap9Q1HDU4 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arhgap9Q1HDU4 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arhgap9Q1HDU4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arhgap9Q1HDU4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arhgap9Q1HDU4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Arhgap9Q1HDU4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Arhgap9Q1HDU4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arhgap9Q1HDU4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Arhgap9Q1HDU4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arhgap9Q1HDU4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arhgap9Q1HDU4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arhgap9Q1HDU4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arhgap9Q1HDU4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arhgap9Q1HDU4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arhgap9Q1HDU4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arhgap9Q1HDU4 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arhgap9Q1HDU4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arhgap9Q1HDU4 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arhgap9Q1HDU4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arhgap9Q1HDU4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arhgap9Q1HDU4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arhgap9Q1HDU4 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arhgap9Q1HDU4 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arhgap9Q1HDU4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arhgap9Q1HDU4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arhgap9Q1HDU4 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arhgap9Q1HDU4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arhgap9Q1HDU4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arhgap9Q1HDU4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Arhgap9Q1HDU4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arhgap9Q1HDU4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arhgap9Q1HDU4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Arhgap9Q1HDU4 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arhgap9Q1HDU4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arhgap9Q1HDU4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arhgap9Q1HDU4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arhgap9Q1HDU4 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arhgap9Q1HDU4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arhgap9Q1HDU4 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgap9Q1HDU4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgap9Q1HDU4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgap9Q1HDU4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgap9Q1HDU4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgap9Q1HDU4 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgap9Q1HDU4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgap9Q1HDU4 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgap9Q1HDU4 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgap9Q1HDU4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgap9Q1HDU4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgap9Q1HDU4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgap9Q1HDU4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgap9Q1HDU4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgap9Q1HDU4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgap9Q1HDU4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgap9Q1HDU4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgap9Q1HDU4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgap9Q1HDU4 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgap9Q1HDU4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgap9Q1HDU4 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgap9Q1HDU4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgap9Q1HDU4 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgap9Q1HDU4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgap9Q1HDU4 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgap9Q1HDU4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgap9Q1HDU4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgap9Q1HDU4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgap9Q1HDU4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgap9Q1HDU4 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgap9Q1HDU4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgap9Q1HDU4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgap9Q1HDU4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgap9Q1HDU4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgap9Q1HDU4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgap9Q1HDU4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgap9Q1HDU4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgap9Q1HDU4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgap9Q1HDU4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgap9Q1HDU4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgap9Q1HDU4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgap9Q1HDU4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgap9Q1HDU4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgap9Q1HDU4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgap9Q1HDU4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgap9Q1HDU4 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgap9Q1HDU4 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgap9Q1HDU4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgap9Q1HDU4 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms