Protein–RNA interactions for Protein: Q1ERP8

Cd300lg, CMRF35-like molecule 9, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lgQ1ERP8 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd300lgQ1ERP8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd300lgQ1ERP8 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd300lgQ1ERP8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd300lgQ1ERP8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd300lgQ1ERP8 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd300lgQ1ERP8 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd300lgQ1ERP8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd300lgQ1ERP8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd300lgQ1ERP8 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd300lgQ1ERP8 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd300lgQ1ERP8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd300lgQ1ERP8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd300lgQ1ERP8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd300lgQ1ERP8 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd300lgQ1ERP8 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd300lgQ1ERP8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd300lgQ1ERP8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd300lgQ1ERP8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd300lgQ1ERP8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd300lgQ1ERP8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd300lgQ1ERP8 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd300lgQ1ERP8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd300lgQ1ERP8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd300lgQ1ERP8 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd300lgQ1ERP8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd300lgQ1ERP8 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd300lgQ1ERP8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd300lgQ1ERP8 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd300lgQ1ERP8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd300lgQ1ERP8 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd300lgQ1ERP8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd300lgQ1ERP8 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd300lgQ1ERP8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd300lgQ1ERP8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd300lgQ1ERP8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd300lgQ1ERP8 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd300lgQ1ERP8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd300lgQ1ERP8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd300lgQ1ERP8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd300lgQ1ERP8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd300lgQ1ERP8 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd300lgQ1ERP8 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd300lgQ1ERP8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd300lgQ1ERP8 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd300lgQ1ERP8 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd300lgQ1ERP8 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd300lgQ1ERP8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd300lgQ1ERP8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd300lgQ1ERP8 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd300lgQ1ERP8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd300lgQ1ERP8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd300lgQ1ERP8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd300lgQ1ERP8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd300lgQ1ERP8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd300lgQ1ERP8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd300lgQ1ERP8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cd300lgQ1ERP8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cd300lgQ1ERP8 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cd300lgQ1ERP8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd300lgQ1ERP8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd300lgQ1ERP8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd300lgQ1ERP8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd300lgQ1ERP8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd300lgQ1ERP8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd300lgQ1ERP8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd300lgQ1ERP8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd300lgQ1ERP8 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd300lgQ1ERP8 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd300lgQ1ERP8 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd300lgQ1ERP8 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd300lgQ1ERP8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd300lgQ1ERP8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd300lgQ1ERP8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd300lgQ1ERP8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd300lgQ1ERP8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd300lgQ1ERP8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd300lgQ1ERP8 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd300lgQ1ERP8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd300lgQ1ERP8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd300lgQ1ERP8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd300lgQ1ERP8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd300lgQ1ERP8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd300lgQ1ERP8 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd300lgQ1ERP8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd300lgQ1ERP8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd300lgQ1ERP8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd300lgQ1ERP8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd300lgQ1ERP8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd300lgQ1ERP8 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd300lgQ1ERP8 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd300lgQ1ERP8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd300lgQ1ERP8 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd300lgQ1ERP8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd300lgQ1ERP8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd300lgQ1ERP8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd300lgQ1ERP8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd300lgQ1ERP8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd300lgQ1ERP8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd300lgQ1ERP8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms