Protein–RNA interactions for Protein: Q14DL3

Lrriq3, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 633 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq3Q14DL3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrriq3Q14DL3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrriq3Q14DL3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrriq3Q14DL3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrriq3Q14DL3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrriq3Q14DL3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrriq3Q14DL3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrriq3Q14DL3 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrriq3Q14DL3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrriq3Q14DL3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrriq3Q14DL3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrriq3Q14DL3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrriq3Q14DL3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrriq3Q14DL3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrriq3Q14DL3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrriq3Q14DL3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrriq3Q14DL3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrriq3Q14DL3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrriq3Q14DL3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrriq3Q14DL3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrriq3Q14DL3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrriq3Q14DL3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrriq3Q14DL3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrriq3Q14DL3 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrriq3Q14DL3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrriq3Q14DL3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrriq3Q14DL3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrriq3Q14DL3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrriq3Q14DL3 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrriq3Q14DL3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrriq3Q14DL3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrriq3Q14DL3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrriq3Q14DL3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrriq3Q14DL3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrriq3Q14DL3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrriq3Q14DL3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrriq3Q14DL3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrriq3Q14DL3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrriq3Q14DL3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrriq3Q14DL3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrriq3Q14DL3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrriq3Q14DL3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrriq3Q14DL3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrriq3Q14DL3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrriq3Q14DL3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrriq3Q14DL3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrriq3Q14DL3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrriq3Q14DL3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrriq3Q14DL3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrriq3Q14DL3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrriq3Q14DL3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrriq3Q14DL3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrriq3Q14DL3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrriq3Q14DL3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrriq3Q14DL3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrriq3Q14DL3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrriq3Q14DL3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrriq3Q14DL3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrriq3Q14DL3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrriq3Q14DL3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrriq3Q14DL3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrriq3Q14DL3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrriq3Q14DL3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrriq3Q14DL3 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrriq3Q14DL3 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrriq3Q14DL3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrriq3Q14DL3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrriq3Q14DL3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrriq3Q14DL3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrriq3Q14DL3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrriq3Q14DL3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrriq3Q14DL3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrriq3Q14DL3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrriq3Q14DL3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrriq3Q14DL3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrriq3Q14DL3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrriq3Q14DL3 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrriq3Q14DL3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrriq3Q14DL3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrriq3Q14DL3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrriq3Q14DL3 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrriq3Q14DL3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrriq3Q14DL3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrriq3Q14DL3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrriq3Q14DL3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrriq3Q14DL3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrriq3Q14DL3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrriq3Q14DL3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrriq3Q14DL3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrriq3Q14DL3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrriq3Q14DL3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrriq3Q14DL3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrriq3Q14DL3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrriq3Q14DL3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrriq3Q14DL3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrriq3Q14DL3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrriq3Q14DL3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrriq3Q14DL3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrriq3Q14DL3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrriq3Q14DL3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms