Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptcd3Q14C51 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptcd3Q14C51 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptcd3Q14C51 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptcd3Q14C51 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptcd3Q14C51 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptcd3Q14C51 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptcd3Q14C51 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptcd3Q14C51 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptcd3Q14C51 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptcd3Q14C51 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptcd3Q14C51 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptcd3Q14C51 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptcd3Q14C51 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptcd3Q14C51 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptcd3Q14C51 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptcd3Q14C51 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptcd3Q14C51 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptcd3Q14C51 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptcd3Q14C51 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptcd3Q14C51 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptcd3Q14C51 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptcd3Q14C51 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptcd3Q14C51 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptcd3Q14C51 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptcd3Q14C51 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptcd3Q14C51 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptcd3Q14C51 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptcd3Q14C51 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptcd3Q14C51 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptcd3Q14C51 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptcd3Q14C51 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptcd3Q14C51 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptcd3Q14C51 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptcd3Q14C51 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptcd3Q14C51 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptcd3Q14C51 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptcd3Q14C51 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptcd3Q14C51 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptcd3Q14C51 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptcd3Q14C51 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptcd3Q14C51 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptcd3Q14C51 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptcd3Q14C51 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptcd3Q14C51 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptcd3Q14C51 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptcd3Q14C51 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptcd3Q14C51 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptcd3Q14C51 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptcd3Q14C51 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms