Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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ptchd1Q14B62 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
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ptchd1Q14B62 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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ptchd1Q14B62 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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ptchd1Q14B62 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ptchd1Q14B62 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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ptchd1Q14B62 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ptchd1Q14B62 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ptchd1Q14B62 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ptchd1Q14B62 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ptchd1Q14B62 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ptchd1Q14B62 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ptchd1Q14B62 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ptchd1Q14B62 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ptchd1Q14B62 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ptchd1Q14B62 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ptchd1Q14B62 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ptchd1Q14B62 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ptchd1Q14B62 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ptchd1Q14B62 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ptchd1Q14B62 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ptchd1Q14B62 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ptchd1Q14B62 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ptchd1Q14B62 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ptchd1Q14B62 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ptchd1Q14B62 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ptchd1Q14B62 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ptchd1Q14B62 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ptchd1Q14B62 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ptchd1Q14B62 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ptchd1Q14B62 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ptchd1Q14B62 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ptchd1Q14B62 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ptchd1Q14B62 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ptchd1Q14B62 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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