Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpusd2Q149F1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpusd2Q149F1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpusd2Q149F1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpusd2Q149F1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpusd2Q149F1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpusd2Q149F1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpusd2Q149F1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpusd2Q149F1 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpusd2Q149F1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpusd2Q149F1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpusd2Q149F1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpusd2Q149F1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpusd2Q149F1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpusd2Q149F1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpusd2Q149F1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpusd2Q149F1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpusd2Q149F1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpusd2Q149F1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpusd2Q149F1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpusd2Q149F1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpusd2Q149F1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpusd2Q149F1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpusd2Q149F1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpusd2Q149F1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpusd2Q149F1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpusd2Q149F1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpusd2Q149F1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpusd2Q149F1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpusd2Q149F1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpusd2Q149F1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpusd2Q149F1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpusd2Q149F1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpusd2Q149F1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpusd2Q149F1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpusd2Q149F1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpusd2Q149F1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpusd2Q149F1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpusd2Q149F1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpusd2Q149F1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpusd2Q149F1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpusd2Q149F1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpusd2Q149F1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpusd2Q149F1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpusd2Q149F1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpusd2Q149F1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpusd2Q149F1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpusd2Q149F1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpusd2Q149F1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpusd2Q149F1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpusd2Q149F1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpusd2Q149F1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpusd2Q149F1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpusd2Q149F1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpusd2Q149F1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpusd2Q149F1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpusd2Q149F1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpusd2Q149F1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpusd2Q149F1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpusd2Q149F1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpusd2Q149F1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpusd2Q149F1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpusd2Q149F1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpusd2Q149F1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpusd2Q149F1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpusd2Q149F1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpusd2Q149F1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpusd2Q149F1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpusd2Q149F1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpusd2Q149F1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpusd2Q149F1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpusd2Q149F1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpusd2Q149F1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpusd2Q149F1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpusd2Q149F1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpusd2Q149F1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpusd2Q149F1 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpusd2Q149F1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpusd2Q149F1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpusd2Q149F1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpusd2Q149F1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpusd2Q149F1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpusd2Q149F1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpusd2Q149F1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpusd2Q149F1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpusd2Q149F1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpusd2Q149F1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpusd2Q149F1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpusd2Q149F1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpusd2Q149F1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpusd2Q149F1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpusd2Q149F1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpusd2Q149F1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpusd2Q149F1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpusd2Q149F1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpusd2Q149F1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpusd2Q149F1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpusd2Q149F1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpusd2Q149F1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpusd2Q149F1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms