Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGM9

Rtel1, Regulator of telomere elongation helicase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtel1Q0VGM9 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rtel1Q0VGM9 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rtel1Q0VGM9 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rtel1Q0VGM9 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rtel1Q0VGM9 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rtel1Q0VGM9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rtel1Q0VGM9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rtel1Q0VGM9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rtel1Q0VGM9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rtel1Q0VGM9 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rtel1Q0VGM9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rtel1Q0VGM9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rtel1Q0VGM9 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rtel1Q0VGM9 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rtel1Q0VGM9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rtel1Q0VGM9 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rtel1Q0VGM9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rtel1Q0VGM9 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rtel1Q0VGM9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rtel1Q0VGM9 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rtel1Q0VGM9 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rtel1Q0VGM9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rtel1Q0VGM9 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rtel1Q0VGM9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rtel1Q0VGM9 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rtel1Q0VGM9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rtel1Q0VGM9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rtel1Q0VGM9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rtel1Q0VGM9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rtel1Q0VGM9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rtel1Q0VGM9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rtel1Q0VGM9 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rtel1Q0VGM9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Rtel1Q0VGM9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rtel1Q0VGM9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rtel1Q0VGM9 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rtel1Q0VGM9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rtel1Q0VGM9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rtel1Q0VGM9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rtel1Q0VGM9 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rtel1Q0VGM9 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rtel1Q0VGM9 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rtel1Q0VGM9 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rtel1Q0VGM9 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rtel1Q0VGM9 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rtel1Q0VGM9 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rtel1Q0VGM9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rtel1Q0VGM9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rtel1Q0VGM9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rtel1Q0VGM9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rtel1Q0VGM9 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rtel1Q0VGM9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rtel1Q0VGM9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rtel1Q0VGM9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rtel1Q0VGM9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rtel1Q0VGM9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rtel1Q0VGM9 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rtel1Q0VGM9 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rtel1Q0VGM9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rtel1Q0VGM9 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rtel1Q0VGM9 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rtel1Q0VGM9 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rtel1Q0VGM9 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rtel1Q0VGM9 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rtel1Q0VGM9 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rtel1Q0VGM9 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rtel1Q0VGM9 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rtel1Q0VGM9 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rtel1Q0VGM9 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rtel1Q0VGM9 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rtel1Q0VGM9 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rtel1Q0VGM9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rtel1Q0VGM9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rtel1Q0VGM9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rtel1Q0VGM9 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms