Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF58

Col19a1, Collagen alpha-1(XIX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col19a1Q0VF58 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col19a1Q0VF58 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col19a1Q0VF58 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Col19a1Q0VF58 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col19a1Q0VF58 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col19a1Q0VF58 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col19a1Q0VF58 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col19a1Q0VF58 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col19a1Q0VF58 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col19a1Q0VF58 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col19a1Q0VF58 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col19a1Q0VF58 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col19a1Q0VF58 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col19a1Q0VF58 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col19a1Q0VF58 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Col19a1Q0VF58 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col19a1Q0VF58 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col19a1Q0VF58 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col19a1Q0VF58 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col19a1Q0VF58 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Col19a1Q0VF58 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col19a1Q0VF58 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col19a1Q0VF58 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col19a1Q0VF58 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col19a1Q0VF58 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col19a1Q0VF58 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col19a1Q0VF58 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col19a1Q0VF58 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col19a1Q0VF58 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col19a1Q0VF58 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col19a1Q0VF58 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col19a1Q0VF58 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col19a1Q0VF58 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col19a1Q0VF58 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col19a1Q0VF58 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col19a1Q0VF58 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col19a1Q0VF58 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col19a1Q0VF58 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col19a1Q0VF58 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col19a1Q0VF58 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col19a1Q0VF58 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col19a1Q0VF58 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col19a1Q0VF58 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Col19a1Q0VF58 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col19a1Q0VF58 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col19a1Q0VF58 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col19a1Q0VF58 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col19a1Q0VF58 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col19a1Q0VF58 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col19a1Q0VF58 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col19a1Q0VF58 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col19a1Q0VF58 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Col19a1Q0VF58 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Col19a1Q0VF58 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Col19a1Q0VF58 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Col19a1Q0VF58 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Col19a1Q0VF58 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Col19a1Q0VF58 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Col19a1Q0VF58 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Col19a1Q0VF58 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Col19a1Q0VF58 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Col19a1Q0VF58 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col19a1Q0VF58 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col19a1Q0VF58 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col19a1Q0VF58 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col19a1Q0VF58 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col19a1Q0VF58 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col19a1Q0VF58 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col19a1Q0VF58 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col19a1Q0VF58 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col19a1Q0VF58 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col19a1Q0VF58 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col19a1Q0VF58 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col19a1Q0VF58 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col19a1Q0VF58 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col19a1Q0VF58 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col19a1Q0VF58 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col19a1Q0VF58 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col19a1Q0VF58 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col19a1Q0VF58 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col19a1Q0VF58 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col19a1Q0VF58 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col19a1Q0VF58 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col19a1Q0VF58 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col19a1Q0VF58 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Col19a1Q0VF58 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Col19a1Q0VF58 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Col19a1Q0VF58 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col19a1Q0VF58 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col19a1Q0VF58 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col19a1Q0VF58 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col19a1Q0VF58 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col19a1Q0VF58 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col19a1Q0VF58 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col19a1Q0VF58 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col19a1Q0VF58 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col19a1Q0VF58 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col19a1Q0VF58 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col19a1Q0VF58 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col19a1Q0VF58 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms