Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpne7Q0VE82 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpne7Q0VE82 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpne7Q0VE82 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpne7Q0VE82 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpne7Q0VE82 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpne7Q0VE82 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpne7Q0VE82 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpne7Q0VE82 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpne7Q0VE82 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpne7Q0VE82 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpne7Q0VE82 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpne7Q0VE82 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpne7Q0VE82 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpne7Q0VE82 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpne7Q0VE82 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpne7Q0VE82 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpne7Q0VE82 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpne7Q0VE82 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpne7Q0VE82 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpne7Q0VE82 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpne7Q0VE82 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpne7Q0VE82 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpne7Q0VE82 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpne7Q0VE82 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpne7Q0VE82 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpne7Q0VE82 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpne7Q0VE82 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpne7Q0VE82 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpne7Q0VE82 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpne7Q0VE82 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpne7Q0VE82 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpne7Q0VE82 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpne7Q0VE82 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpne7Q0VE82 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpne7Q0VE82 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cpne7Q0VE82 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cpne7Q0VE82 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cpne7Q0VE82 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cpne7Q0VE82 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cpne7Q0VE82 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cpne7Q0VE82 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cpne7Q0VE82 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cpne7Q0VE82 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms