Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5X1

Lrriq1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq1Q0P5X1 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lrriq1Q0P5X1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lrriq1Q0P5X1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lrriq1Q0P5X1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lrriq1Q0P5X1 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lrriq1Q0P5X1 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lrriq1Q0P5X1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lrriq1Q0P5X1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lrriq1Q0P5X1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lrriq1Q0P5X1 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Lrriq1Q0P5X1 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lrriq1Q0P5X1 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lrriq1Q0P5X1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lrriq1Q0P5X1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lrriq1Q0P5X1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lrriq1Q0P5X1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lrriq1Q0P5X1 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Lrriq1Q0P5X1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lrriq1Q0P5X1 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Lrriq1Q0P5X1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lrriq1Q0P5X1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lrriq1Q0P5X1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lrriq1Q0P5X1 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lrriq1Q0P5X1 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lrriq1Q0P5X1 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lrriq1Q0P5X1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lrriq1Q0P5X1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lrriq1Q0P5X1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lrriq1Q0P5X1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lrriq1Q0P5X1 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lrriq1Q0P5X1 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lrriq1Q0P5X1 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lrriq1Q0P5X1 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lrriq1Q0P5X1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lrriq1Q0P5X1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lrriq1Q0P5X1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lrriq1Q0P5X1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lrriq1Q0P5X1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lrriq1Q0P5X1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lrriq1Q0P5X1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lrriq1Q0P5X1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Lrriq1Q0P5X1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lrriq1Q0P5X1 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lrriq1Q0P5X1 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lrriq1Q0P5X1 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lrriq1Q0P5X1 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lrriq1Q0P5X1 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Lrriq1Q0P5X1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lrriq1Q0P5X1 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lrriq1Q0P5X1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lrriq1Q0P5X1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lrriq1Q0P5X1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lrriq1Q0P5X1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Lrriq1Q0P5X1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Lrriq1Q0P5X1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Lrriq1Q0P5X1 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Lrriq1Q0P5X1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Lrriq1Q0P5X1 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Lrriq1Q0P5X1 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Lrriq1Q0P5X1 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Lrriq1Q0P5X1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Lrriq1Q0P5X1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Lrriq1Q0P5X1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Lrriq1Q0P5X1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Lrriq1Q0P5X1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Lrriq1Q0P5X1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Lrriq1Q0P5X1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Lrriq1Q0P5X1 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Lrriq1Q0P5X1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Lrriq1Q0P5X1 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Lrriq1Q0P5X1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Lrriq1Q0P5X1 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Lrriq1Q0P5X1 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Lrriq1Q0P5X1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Lrriq1Q0P5X1 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Lrriq1Q0P5X1 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Lrriq1Q0P5X1 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Lrriq1Q0P5X1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Lrriq1Q0P5X1 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Lrriq1Q0P5X1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Lrriq1Q0P5X1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Lrriq1Q0P5X1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Lrriq1Q0P5X1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Lrriq1Q0P5X1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Lrriq1Q0P5X1 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Lrriq1Q0P5X1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Lrriq1Q0P5X1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Lrriq1Q0P5X1 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Lrriq1Q0P5X1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Lrriq1Q0P5X1 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Lrriq1Q0P5X1 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lrriq1Q0P5X1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lrriq1Q0P5X1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lrriq1Q0P5X1 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lrriq1Q0P5X1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lrriq1Q0P5X1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lrriq1Q0P5X1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lrriq1Q0P5X1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lrriq1Q0P5X1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lrriq1Q0P5X1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms