Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Vps8Q0P5W1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Vps8Q0P5W1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Vps8Q0P5W1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Vps8Q0P5W1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Vps8Q0P5W1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Vps8Q0P5W1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vps8Q0P5W1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vps8Q0P5W1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vps8Q0P5W1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vps8Q0P5W1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vps8Q0P5W1 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vps8Q0P5W1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vps8Q0P5W1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Vps8Q0P5W1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vps8Q0P5W1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vps8Q0P5W1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vps8Q0P5W1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vps8Q0P5W1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vps8Q0P5W1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Vps8Q0P5W1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vps8Q0P5W1 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vps8Q0P5W1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Vps8Q0P5W1 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vps8Q0P5W1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Vps8Q0P5W1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vps8Q0P5W1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vps8Q0P5W1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vps8Q0P5W1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vps8Q0P5W1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Vps8Q0P5W1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vps8Q0P5W1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vps8Q0P5W1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vps8Q0P5W1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vps8Q0P5W1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vps8Q0P5W1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vps8Q0P5W1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vps8Q0P5W1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vps8Q0P5W1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vps8Q0P5W1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vps8Q0P5W1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vps8Q0P5W1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vps8Q0P5W1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vps8Q0P5W1 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vps8Q0P5W1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Vps8Q0P5W1 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vps8Q0P5W1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vps8Q0P5W1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vps8Q0P5W1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vps8Q0P5W1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vps8Q0P5W1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vps8Q0P5W1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vps8Q0P5W1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Vps8Q0P5W1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Vps8Q0P5W1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Vps8Q0P5W1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Vps8Q0P5W1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Vps8Q0P5W1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Vps8Q0P5W1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Vps8Q0P5W1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Vps8Q0P5W1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Vps8Q0P5W1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Vps8Q0P5W1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Vps8Q0P5W1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Vps8Q0P5W1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Vps8Q0P5W1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Vps8Q0P5W1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Vps8Q0P5W1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Vps8Q0P5W1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vps8Q0P5W1 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vps8Q0P5W1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vps8Q0P5W1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vps8Q0P5W1 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vps8Q0P5W1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Vps8Q0P5W1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vps8Q0P5W1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vps8Q0P5W1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vps8Q0P5W1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vps8Q0P5W1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Vps8Q0P5W1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vps8Q0P5W1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vps8Q0P5W1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vps8Q0P5W1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vps8Q0P5W1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vps8Q0P5W1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vps8Q0P5W1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vps8Q0P5W1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vps8Q0P5W1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Vps8Q0P5W1 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vps8Q0P5W1 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vps8Q0P5W1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Vps8Q0P5W1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vps8Q0P5W1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vps8Q0P5W1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vps8Q0P5W1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vps8Q0P5W1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vps8Q0P5W1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vps8Q0P5W1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vps8Q0P5W1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Vps8Q0P5W1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms