Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spata18Q0P557 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spata18Q0P557 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spata18Q0P557 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spata18Q0P557 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spata18Q0P557 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spata18Q0P557 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spata18Q0P557 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spata18Q0P557 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spata18Q0P557 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spata18Q0P557 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spata18Q0P557 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spata18Q0P557 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Spata18Q0P557 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Spata18Q0P557 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Spata18Q0P557 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Spata18Q0P557 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Spata18Q0P557 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Spata18Q0P557 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Spata18Q0P557 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Spata18Q0P557 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Spata18Q0P557 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Spata18Q0P557 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Spata18Q0P557 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Spata18Q0P557 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Spata18Q0P557 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Spata18Q0P557 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Spata18Q0P557 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Spata18Q0P557 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Spata18Q0P557 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Spata18Q0P557 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Spata18Q0P557 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Spata18Q0P557 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Spata18Q0P557 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Spata18Q0P557 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Spata18Q0P557 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Spata18Q0P557 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Spata18Q0P557 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Spata18Q0P557 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Spata18Q0P557 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Spata18Q0P557 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Spata18Q0P557 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Spata18Q0P557 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Spata18Q0P557 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spata18Q0P557 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spata18Q0P557 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spata18Q0P557 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spata18Q0P557 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spata18Q0P557 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spata18Q0P557 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spata18Q0P557 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spata18Q0P557 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spata18Q0P557 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spata18Q0P557 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spata18Q0P557 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Spata18Q0P557 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Spata18Q0P557 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Spata18Q0P557 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Spata18Q0P557 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Spata18Q0P557 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Spata18Q0P557 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Spata18Q0P557 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Spata18Q0P557 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Spata18Q0P557 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Spata18Q0P557 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Spata18Q0P557 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Spata18Q0P557 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Spata18Q0P557 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Spata18Q0P557 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Spata18Q0P557 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Spata18Q0P557 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Spata18Q0P557 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Spata18Q0P557 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Spata18Q0P557 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Spata18Q0P557 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Spata18Q0P557 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Spata18Q0P557 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Spata18Q0P557 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Spata18Q0P557 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Spata18Q0P557 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Spata18Q0P557 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Spata18Q0P557 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Spata18Q0P557 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Spata18Q0P557 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Spata18Q0P557 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Spata18Q0P557 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Spata18Q0P557 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Spata18Q0P557 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Spata18Q0P557 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Spata18Q0P557 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spata18Q0P557 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spata18Q0P557 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spata18Q0P557 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spata18Q0P557 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spata18Q0P557 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spata18Q0P557 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spata18Q0P557 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spata18Q0P557 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Spata18Q0P557 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spata18Q0P557 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms