Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ubxn2bQ0KL01 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ubxn2bQ0KL01 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ubxn2bQ0KL01 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ubxn2bQ0KL01 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ubxn2bQ0KL01 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ubxn2bQ0KL01 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ubxn2bQ0KL01 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ubxn2bQ0KL01 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ubxn2bQ0KL01 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Ubxn2bQ0KL01 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ubxn2bQ0KL01 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ubxn2bQ0KL01 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ubxn2bQ0KL01 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Ubxn2bQ0KL01 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ubxn2bQ0KL01 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ubxn2bQ0KL01 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ubxn2bQ0KL01 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ubxn2bQ0KL01 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ubxn2bQ0KL01 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Ubxn2bQ0KL01 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Ubxn2bQ0KL01 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ubxn2bQ0KL01 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ubxn2bQ0KL01 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ubxn2bQ0KL01 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ubxn2bQ0KL01 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ubxn2bQ0KL01 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ubxn2bQ0KL01 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ubxn2bQ0KL01 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ubxn2bQ0KL01 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ubxn2bQ0KL01 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ubxn2bQ0KL01 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ubxn2bQ0KL01 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ubxn2bQ0KL01 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ubxn2bQ0KL01 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ubxn2bQ0KL01 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ubxn2bQ0KL01 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ubxn2bQ0KL01 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ubxn2bQ0KL01 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ubxn2bQ0KL01 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ubxn2bQ0KL01 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ubxn2bQ0KL01 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ubxn2bQ0KL01 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ubxn2bQ0KL01 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ubxn2bQ0KL01 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ubxn2bQ0KL01 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ubxn2bQ0KL01 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ubxn2bQ0KL01 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ubxn2bQ0KL01 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ubxn2bQ0KL01 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ubxn2bQ0KL01 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ubxn2bQ0KL01 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ubxn2bQ0KL01 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ubxn2bQ0KL01 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Ubxn2bQ0KL01 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Ubxn2bQ0KL01 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ubxn2bQ0KL01 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ubxn2bQ0KL01 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ubxn2bQ0KL01 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Ubxn2bQ0KL01 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ubxn2bQ0KL01 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ubxn2bQ0KL01 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ubxn2bQ0KL01 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ubxn2bQ0KL01 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ubxn2bQ0KL01 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ubxn2bQ0KL01 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ubxn2bQ0KL01 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ubxn2bQ0KL01 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ubxn2bQ0KL01 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ubxn2bQ0KL01 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Ubxn2bQ0KL01 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ubxn2bQ0KL01 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ubxn2bQ0KL01 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ubxn2bQ0KL01 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ubxn2bQ0KL01 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ubxn2bQ0KL01 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ubxn2bQ0KL01 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ubxn2bQ0KL01 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ubxn2bQ0KL01 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ubxn2bQ0KL01 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ubxn2bQ0KL01 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ubxn2bQ0KL01 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ubxn2bQ0KL01 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ubxn2bQ0KL01 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ubxn2bQ0KL01 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ubxn2bQ0KL01 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ubxn2bQ0KL01 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ubxn2bQ0KL01 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ubxn2bQ0KL01 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Ubxn2bQ0KL01 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ubxn2bQ0KL01 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ubxn2bQ0KL01 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ubxn2bQ0KL01 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ubxn2bQ0KL01 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ubxn2bQ0KL01 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ubxn2bQ0KL01 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Ubxn2bQ0KL01 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ubxn2bQ0KL01 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ubxn2bQ0KL01 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ubxn2bQ0KL01 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms