Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ttc21bQ0HA38 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ttc21bQ0HA38 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ttc21bQ0HA38 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ttc21bQ0HA38 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ttc21bQ0HA38 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ttc21bQ0HA38 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ttc21bQ0HA38 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ttc21bQ0HA38 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ttc21bQ0HA38 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ttc21bQ0HA38 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ttc21bQ0HA38 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ttc21bQ0HA38 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ttc21bQ0HA38 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ttc21bQ0HA38 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ttc21bQ0HA38 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ttc21bQ0HA38 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ttc21bQ0HA38 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ttc21bQ0HA38 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ttc21bQ0HA38 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ttc21bQ0HA38 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ttc21bQ0HA38 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ttc21bQ0HA38 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ttc21bQ0HA38 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ttc21bQ0HA38 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ttc21bQ0HA38 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ttc21bQ0HA38 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ttc21bQ0HA38 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ttc21bQ0HA38 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ttc21bQ0HA38 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ttc21bQ0HA38 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ttc21bQ0HA38 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ttc21bQ0HA38 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ttc21bQ0HA38 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ttc21bQ0HA38 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ttc21bQ0HA38 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ttc21bQ0HA38 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ttc21bQ0HA38 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ttc21bQ0HA38 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ttc21bQ0HA38 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ttc21bQ0HA38 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ttc21bQ0HA38 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ttc21bQ0HA38 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ttc21bQ0HA38 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ttc21bQ0HA38 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ttc21bQ0HA38 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ttc21bQ0HA38 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ttc21bQ0HA38 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ttc21bQ0HA38 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ttc21bQ0HA38 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ttc21bQ0HA38 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ttc21bQ0HA38 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ttc21bQ0HA38 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ttc21bQ0HA38 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ttc21bQ0HA38 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ttc21bQ0HA38 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ttc21bQ0HA38 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ttc21bQ0HA38 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ttc21bQ0HA38 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ttc21bQ0HA38 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ttc21bQ0HA38 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ttc21bQ0HA38 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ttc21bQ0HA38 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ttc21bQ0HA38 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ttc21bQ0HA38 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ttc21bQ0HA38 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ttc21bQ0HA38 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ttc21bQ0HA38 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ttc21bQ0HA38 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ttc21bQ0HA38 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ttc21bQ0HA38 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ttc21bQ0HA38 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ttc21bQ0HA38 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ttc21bQ0HA38 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ttc21bQ0HA38 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ttc21bQ0HA38 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ttc21bQ0HA38 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ttc21bQ0HA38 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ttc21bQ0HA38 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ttc21bQ0HA38 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ttc21bQ0HA38 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ttc21bQ0HA38 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ttc21bQ0HA38 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ttc21bQ0HA38 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ttc21bQ0HA38 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ttc21bQ0HA38 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ttc21bQ0HA38 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ttc21bQ0HA38 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ttc21bQ0HA38 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ttc21bQ0HA38 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ttc21bQ0HA38 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ttc21bQ0HA38 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ttc21bQ0HA38 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ttc21bQ0HA38 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ttc21bQ0HA38 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ttc21bQ0HA38 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ttc21bQ0HA38 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ttc21bQ0HA38 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ttc21bQ0HA38 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ttc21bQ0HA38 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms