Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnnm1Q0GA42 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnnm1Q0GA42 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnnm1Q0GA42 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnnm1Q0GA42 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnnm1Q0GA42 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnnm1Q0GA42 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnnm1Q0GA42 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnnm1Q0GA42 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnnm1Q0GA42 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnnm1Q0GA42 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnnm1Q0GA42 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnnm1Q0GA42 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnnm1Q0GA42 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnnm1Q0GA42 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnnm1Q0GA42 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnnm1Q0GA42 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnnm1Q0GA42 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnnm1Q0GA42 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnnm1Q0GA42 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnnm1Q0GA42 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cnnm1Q0GA42 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cnnm1Q0GA42 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cnnm1Q0GA42 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cnnm1Q0GA42 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cnnm1Q0GA42 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Cnnm1Q0GA42 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cnnm1Q0GA42 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cnnm1Q0GA42 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cnnm1Q0GA42 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cnnm1Q0GA42 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cnnm1Q0GA42 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cnnm1Q0GA42 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnnm1Q0GA42 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnnm1Q0GA42 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnnm1Q0GA42 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnnm1Q0GA42 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnnm1Q0GA42 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnnm1Q0GA42 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnnm1Q0GA42 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnnm1Q0GA42 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnnm1Q0GA42 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnnm1Q0GA42 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnnm1Q0GA42 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnnm1Q0GA42 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnnm1Q0GA42 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnnm1Q0GA42 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnnm1Q0GA42 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnnm1Q0GA42 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnnm1Q0GA42 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnnm1Q0GA42 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnnm1Q0GA42 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnnm1Q0GA42 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnnm1Q0GA42 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnnm1Q0GA42 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnnm1Q0GA42 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnnm1Q0GA42 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnnm1Q0GA42 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnnm1Q0GA42 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnnm1Q0GA42 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnnm1Q0GA42 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnnm1Q0GA42 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnnm1Q0GA42 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnnm1Q0GA42 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnnm1Q0GA42 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnnm1Q0GA42 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnnm1Q0GA42 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnnm1Q0GA42 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnnm1Q0GA42 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnnm1Q0GA42 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnnm1Q0GA42 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnnm1Q0GA42 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnnm1Q0GA42 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnnm1Q0GA42 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnnm1Q0GA42 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnnm1Q0GA42 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnnm1Q0GA42 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnnm1Q0GA42 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnnm1Q0GA42 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnnm1Q0GA42 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnnm1Q0GA42 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnnm1Q0GA42 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnnm1Q0GA42 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnnm1Q0GA42 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnnm1Q0GA42 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnnm1Q0GA42 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnnm1Q0GA42 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnnm1Q0GA42 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnnm1Q0GA42 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnnm1Q0GA42 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnnm1Q0GA42 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnnm1Q0GA42 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnnm1Q0GA42 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnnm1Q0GA42 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnnm1Q0GA42 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnnm1Q0GA42 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnnm1Q0GA42 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnnm1Q0GA42 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnnm1Q0GA42 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnnm1Q0GA42 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms