Protein–RNA interactions for Protein: Q09XV5

Chd8, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd8Q09XV5 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd8Q09XV5 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd8Q09XV5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd8Q09XV5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd8Q09XV5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd8Q09XV5 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd8Q09XV5 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd8Q09XV5 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd8Q09XV5 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd8Q09XV5 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd8Q09XV5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd8Q09XV5 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd8Q09XV5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd8Q09XV5 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd8Q09XV5 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd8Q09XV5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd8Q09XV5 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd8Q09XV5 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd8Q09XV5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd8Q09XV5 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd8Q09XV5 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd8Q09XV5 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd8Q09XV5 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd8Q09XV5 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd8Q09XV5 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd8Q09XV5 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd8Q09XV5 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd8Q09XV5 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd8Q09XV5 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd8Q09XV5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd8Q09XV5 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd8Q09XV5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd8Q09XV5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd8Q09XV5 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd8Q09XV5 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd8Q09XV5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd8Q09XV5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd8Q09XV5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chd8Q09XV5 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chd8Q09XV5 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chd8Q09XV5 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chd8Q09XV5 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chd8Q09XV5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chd8Q09XV5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chd8Q09XV5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chd8Q09XV5 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chd8Q09XV5 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chd8Q09XV5 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Chd8Q09XV5 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Chd8Q09XV5 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chd8Q09XV5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chd8Q09XV5 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chd8Q09XV5 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chd8Q09XV5 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chd8Q09XV5 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chd8Q09XV5 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chd8Q09XV5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chd8Q09XV5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chd8Q09XV5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chd8Q09XV5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Chd8Q09XV5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chd8Q09XV5 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chd8Q09XV5 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chd8Q09XV5 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chd8Q09XV5 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chd8Q09XV5 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chd8Q09XV5 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chd8Q09XV5 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chd8Q09XV5 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chd8Q09XV5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chd8Q09XV5 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chd8Q09XV5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chd8Q09XV5 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chd8Q09XV5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chd8Q09XV5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chd8Q09XV5 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chd8Q09XV5 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chd8Q09XV5 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Chd8Q09XV5 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chd8Q09XV5 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chd8Q09XV5 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chd8Q09XV5 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chd8Q09XV5 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chd8Q09XV5 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chd8Q09XV5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chd8Q09XV5 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chd8Q09XV5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chd8Q09XV5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chd8Q09XV5 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chd8Q09XV5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chd8Q09XV5 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Chd8Q09XV5 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chd8Q09XV5 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chd8Q09XV5 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chd8Q09XV5 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Chd8Q09XV5 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chd8Q09XV5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chd8Q09XV5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chd8Q09XV5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chd8Q09XV5 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms