Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms