Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Col9a2Q07643 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Col9a2Q07643 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Col9a2Q07643 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Col9a2Q07643 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Col9a2Q07643 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms