Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms