Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sox12Q04890 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sox12Q04890 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sox12Q04890 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sox12Q04890 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sox12Q04890 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sox12Q04890 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sox12Q04890 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sox12Q04890 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sox12Q04890 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sox12Q04890 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Sox12Q04890 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Sox12Q04890 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sox12Q04890 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Sox12Q04890 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sox12Q04890 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sox12Q04890 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sox12Q04890 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sox12Q04890 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sox12Q04890 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sox12Q04890 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sox12Q04890 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sox12Q04890 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sox12Q04890 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sox12Q04890 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sox12Q04890 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sox12Q04890 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sox12Q04890 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sox12Q04890 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Sox12Q04890 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sox12Q04890 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Sox12Q04890 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sox12Q04890 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Sox12Q04890 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Sox12Q04890 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sox12Q04890 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sox12Q04890 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sox12Q04890 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sox12Q04890 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sox12Q04890 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sox12Q04890 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sox12Q04890 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sox12Q04890 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sox12Q04890 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sox12Q04890 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sox12Q04890 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sox12Q04890 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sox12Q04890 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sox12Q04890 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sox12Q04890 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sox12Q04890 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sox12Q04890 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sox12Q04890 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sox12Q04890 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sox12Q04890 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sox12Q04890 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sox12Q04890 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sox12Q04890 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sox12Q04890 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sox12Q04890 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sox12Q04890 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sox12Q04890 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sox12Q04890 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sox12Q04890 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sox12Q04890 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sox12Q04890 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sox12Q04890 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sox12Q04890 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sox12Q04890 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sox12Q04890 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Sox12Q04890 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sox12Q04890 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sox12Q04890 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sox12Q04890 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sox12Q04890 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sox12Q04890 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sox12Q04890 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sox12Q04890 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sox12Q04890 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sox12Q04890 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sox12Q04890 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sox12Q04890 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sox12Q04890 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sox12Q04890 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sox12Q04890 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sox12Q04890 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sox12Q04890 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sox12Q04890 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Sox12Q04890 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sox12Q04890 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sox12Q04890 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sox12Q04890 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sox12Q04890 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sox12Q04890 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Sox12Q04890 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sox12Q04890 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sox12Q04890 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sox12Q04890 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sox12Q04890 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sox12Q04890 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms