Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sox9Q04887 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sox9Q04887 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sox9Q04887 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sox9Q04887 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sox9Q04887 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox9Q04887 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox9Q04887 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox9Q04887 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox9Q04887 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox9Q04887 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox9Q04887 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox9Q04887 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox9Q04887 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox9Q04887 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox9Q04887 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox9Q04887 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox9Q04887 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox9Q04887 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox9Q04887 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox9Q04887 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox9Q04887 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox9Q04887 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox9Q04887 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox9Q04887 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox9Q04887 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox9Q04887 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox9Q04887 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox9Q04887 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox9Q04887 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox9Q04887 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox9Q04887 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox9Q04887 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox9Q04887 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox9Q04887 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox9Q04887 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox9Q04887 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox9Q04887 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox9Q04887 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox9Q04887 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox9Q04887 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox9Q04887 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox9Q04887 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox9Q04887 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox9Q04887 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox9Q04887 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox9Q04887 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox9Q04887 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox9Q04887 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox9Q04887 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox9Q04887 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox9Q04887 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox9Q04887 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox9Q04887 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox9Q04887 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox9Q04887 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox9Q04887 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox9Q04887 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox9Q04887 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox9Q04887 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox9Q04887 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox9Q04887 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox9Q04887 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox9Q04887 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox9Q04887 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox9Q04887 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox9Q04887 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox9Q04887 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox9Q04887 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox9Q04887 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sox9Q04887 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Sox9Q04887 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sox9Q04887 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sox9Q04887 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sox9Q04887 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sox9Q04887 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sox9Q04887 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sox9Q04887 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sox9Q04887 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sox9Q04887 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sox9Q04887 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox9Q04887 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox9Q04887 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox9Q04887 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox9Q04887 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox9Q04887 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox9Q04887 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox9Q04887 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox9Q04887 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox9Q04887 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox9Q04887 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox9Q04887 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox9Q04887 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox9Q04887 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox9Q04887 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox9Q04887 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox9Q04887 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox9Q04887 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sox9Q04887 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sox9Q04887 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms