Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sox8Q04886 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sox8Q04886 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Sox8Q04886 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sox8Q04886 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sox8Q04886 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sox8Q04886 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sox8Q04886 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sox8Q04886 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sox8Q04886 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sox8Q04886 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sox8Q04886 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox8Q04886 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox8Q04886 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox8Q04886 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox8Q04886 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox8Q04886 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox8Q04886 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox8Q04886 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox8Q04886 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox8Q04886 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox8Q04886 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox8Q04886 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox8Q04886 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox8Q04886 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox8Q04886 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sox8Q04886 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sox8Q04886 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sox8Q04886 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sox8Q04886 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sox8Q04886 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sox8Q04886 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sox8Q04886 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Sox8Q04886 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sox8Q04886 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sox8Q04886 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Sox8Q04886 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Sox8Q04886 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sox8Q04886 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Sox8Q04886 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sox8Q04886 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Sox8Q04886 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sox8Q04886 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sox8Q04886 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sox8Q04886 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sox8Q04886 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.2 ms