Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms