Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Kcnb1Q03717 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kcnb1Q03717 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kcnb1Q03717 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kcnb1Q03717 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kcnb1Q03717 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kcnb1Q03717 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kcnb1Q03717 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kcnb1Q03717 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Kcnb1Q03717 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Kcnb1Q03717 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Kcnb1Q03717 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kcnb1Q03717 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kcnb1Q03717 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kcnb1Q03717 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kcnb1Q03717 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kcnb1Q03717 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kcnb1Q03717 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kcnb1Q03717 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kcnb1Q03717 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kcnb1Q03717 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Kcnb1Q03717 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kcnb1Q03717 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Kcnb1Q03717 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kcnb1Q03717 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kcnb1Q03717 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kcnb1Q03717 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kcnb1Q03717 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kcnb1Q03717 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kcnb1Q03717 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kcnb1Q03717 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kcnb1Q03717 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kcnb1Q03717 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kcnb1Q03717 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kcnb1Q03717 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kcnb1Q03717 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kcnb1Q03717 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kcnb1Q03717 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kcnb1Q03717 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kcnb1Q03717 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kcnb1Q03717 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Kcnb1Q03717 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kcnb1Q03717 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kcnb1Q03717 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kcnb1Q03717 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kcnb1Q03717 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kcnb1Q03717 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kcnb1Q03717 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kcnb1Q03717 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kcnb1Q03717 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kcnb1Q03717 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kcnb1Q03717 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Kcnb1Q03717 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Kcnb1Q03717 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kcnb1Q03717 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kcnb1Q03717 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kcnb1Q03717 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kcnb1Q03717 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kcnb1Q03717 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kcnb1Q03717 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kcnb1Q03717 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kcnb1Q03717 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kcnb1Q03717 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Kcnb1Q03717 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kcnb1Q03717 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kcnb1Q03717 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kcnb1Q03717 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kcnb1Q03717 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kcnb1Q03717 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kcnb1Q03717 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kcnb1Q03717 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kcnb1Q03717 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kcnb1Q03717 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Kcnb1Q03717 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kcnb1Q03717 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kcnb1Q03717 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kcnb1Q03717 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kcnb1Q03717 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kcnb1Q03717 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kcnb1Q03717 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kcnb1Q03717 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kcnb1Q03717 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kcnb1Q03717 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kcnb1Q03717 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kcnb1Q03717 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kcnb1Q03717 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kcnb1Q03717 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kcnb1Q03717 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kcnb1Q03717 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kcnb1Q03717 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kcnb1Q03717 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kcnb1Q03717 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kcnb1Q03717 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kcnb1Q03717 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kcnb1Q03717 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kcnb1Q03717 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Kcnb1Q03717 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Kcnb1Q03717 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Kcnb1Q03717 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Kcnb1Q03717 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms