Protein–RNA interactions for Protein: Q03402

Crisp3, Cysteine-rich secretory protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crisp3Q03402 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms